Desde el genoma a las proteínas del virus del Síndrome Respiratorio Agudo Severo-Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), una revisión

Autores/as

  • Michelle Santoyo Suárez Laboratorio de Biología Molecular, Departamento de Investigación en Salud, Facultad de Medicina, Unidad Sureste,UAdeC Autor/a
  • Jacziry Constante Laboratorio de Biología Molecular, Departamento de Investigación en Salud, Facultad de Medicina, Unidad Sureste, UAdeC Autor/a
  • Aylin Arce Hernandez Laboratorio de Biología Molecular, Departamento de Investigación en Salud, Facultad de Medicina, Unidad Sureste, UAdeC Autor/a
  • Mayela Del Angel Martínez Laboratorio de Biología Molecular, Departamento de Investigación en Salud, Facultad de Medicina, Unidad Sureste, UAdeC Autor/a
  • Gilberto Esquivel Muñoz Laboratorio de Biología Molecular, Departamento de Investigación en Salud, Facultad de Medicina, Unidad Sureste, UAdeC Autor/a
  • Jesus Morlett Chávez Laboratorio de Biología Molecular, Departamento de Investigación en Salud, Facultad de Medicina, Unidad Sureste, UAdeC Autor/a https://orcid.org/0000-0001-7988-423X (no autenticado)
  • Carlos Barrera Ramirez Departamento de Medicina Interna, Departamento de Investigación y Enseñanza, Hospital Universitario “Dr. Gonzalo Valdés Valdés", Unidad Sureste UAdeC Autor/a
  • Julio Martínez Gallegos Departamento de Medicina Interna, Departamento de Investigación y Enseñanza, Hospital Universitario “Dr. Gonzalo Valdés Valdés", Unidad Sureste, UAdeC Autor/a

Palabras clave:

SARS-CoV-2,, COVID19, proteómica, ARN viral

Resumen

A finales del 2019 emergió el virus conocido como el virus del Síndrome Respiratorio Agudo Severo-Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) provocando la enfermedad COVID19. En el 2020, el SARS-CoV-2 se había esparcido por Europa y África, hasta llegar al continente americano. El SARS-CoV-2 es de ARN de cadena sencilla, sentido positivo, el cual, codifica para proteínas estructurales, proteínas no estructurales y proteínas accesorias. Cabe mencionar que existe escasa información de la biología del SARS-CoV-2, sin embargo, su parecido con el SARS-CoV, permite hipotetizar las funciones de cada proteína. Además, se ha observado que el genoma de SARS-CoV-2 presenta variantes génicas, pero la expresión y función de las variantes proteicas aun es desconocida. Los signos y síntomas causados por COVID19, son comparados a los que produce el virus de la influenza H1N1, incluidos la tos, temperatura elevada, disnea, diarrea, debilidad y fatiga, entre otros. Para el diagnóstico, se cuenta con métodos moleculares como detección de anticuerpos (IgG e IgM), pero estos resultan ser de poca especificidad. Por otro lado, la reacción en cadena de la polimerasa - transcriptasa reversa, es el método más confiable para identificar el SARS-CoV-2. El tratamiento clínico en pacientes con COVID19 incluye medidas de prevención y control de infecciones; sin embargo, no existe tratamiento específico. Algunos tratamientos propuestos, son inhibidores de los receptores ACE2, inhibidores de la ARN polimerasa dependiente de ARN, entre otros. En el presente trabajo, se pretende hacer una búsqueda y discusión de la información en proteómica que sirva de base para desarrollar estrategias diagnósticas y terapéuticas en contra del SARS-CoV-2 y del COVID19.

Referencias

Ahmed, S. F., Quadeer, A. A., & McKay, M. R. (2020). Preliminary Identification of Potential Vaccine Targets for the COVID-19 Coronavirus (SARS-CoV-2) Based on SARS-CoV Immunological Studies. Viruses, 12(254): 1-15. https://doi.org/10.3390/v12030254 Andersen, K. G., Rambaut, A., Lipkin, W. I., Holmes, E. C., & Garry, R. F. (2020). The proximal origin of SARS-CoV-2. Nat Med, 26(4): 450-452.https://doi.org/10.1038/s41591-020-0820-9

Cao, Y., Li, L., Feng, Z., Wan, S., Huang, P., Sun, X., Wen, F., Huang, X., Ning, G., & Wang, W. (2020). Comparative genetic analysis of the novel coronavirus (2019-nCoV/SARS- CoV-2) receptor ACE2 in different populations. Cell Discov, 6(11): 1-4. https://doi.org/10.1038/s41421-020-0147-1

Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of, V. (2020). The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. Nat Microbiol, 5(4): 536-544. https://doi.org/10.1038/s41564-020-0695-z

COVID-19 Treatment Guidelines Panel. Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Treatment Guidelines. National Institutes of Health. (2020). https://www.covid19treatmentguidelines.nih.gov/.

Davidson, A. D., Williamson, M. K., Lewis, S., Shoemark, D., Carroll, M. W., Heesom, K., Zambon, M., Ellis, J., Lewis, P. A., Hiscox, J. A., & Matthews, D. A. (2020). Characterisation of the transcriptome and proteome of SARS-CoV-2 using direct RNA sequencing and tandem mass spectrometry reveals evidence for a cell passage induced in-frame deletion in the spike glycoprotein that removes the furin-like cleavage site. bioRxiv, 1(1): 1-39. https://doi.org/10.1101/2020.03.22.002204

Gao, J., Tian, Z., & Yang, X. (2020). Breakthrough: Chloroquine phosphate has shown apparent efficacy in treatment of COVID-19 associated pneumonia in clinical studies. Biosci Trends, 14(1): 72-73. https://doi.org/10.5582/bst.2020.01047

Gautret, P., Lagier, J. C., Parola, P., Hoang, V. T., Meddeb, L., Mailhe, M., Doudier, B., Courjon, J., Giordanengo, V., Vieira, V. E., Dupont, H. T., Honore, S., Colson, P., Chabriere, E., La Scola, B., Rolain, J. M., Brouqui, P., & Raoult, D. (2020). Hydroxychloroquine and azithromycin as a treatment of COVID-19: results of an open-label non-randomized clinical trial. Int J Antimicrob Agents, 56: 105949- 105955. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2020.105949

Giri, R., Bhardwaj, T., Shegane, M., Gehi, B. R., Kumar, P., Gadhave, K., Oldfield, C. J., & Uversky, V. N. (2020). Dark Proteome of Newly Emerged SARS-CoV-2 in Comparison with Human and Bat Coronaviruses. bioRxiv, 1(1): 1-59. https://doi.org/10.1101/2020.03.13.990598

Grenga L, G. F., Pible O, Gaillard JC, Gouveia D, et al (2020). Shotgun proteomics of SARS- CoV-2 infected cells and its application to the optimisation of whole viral particle antigen production for vaccines. bioRxiv, 1(1):1-18. https://doi.org/10.1101/2020.04.17.046193

Gurwitz, D. (2020). Angiotensin receptor blockers as tentative SARS-CoV-2 therapeutics. Drug Dev Res, 1(1), 1-4. https://doi.org/10.1002/ddr.21656

Han, H., Yang, L., Liu, R., Liu, F., Wu, K. L., Li, J., Liu, X. H., & Zhu, C. L. (2020). Prominent changes in blood coagulation of patients with SARS-CoV-2 infection. Clin Chem Lab Med, 1(1): 1-5. https://doi.org/10.1515/cclm-2020-0188

Jiang, X., Rayner, S., & Luo, M. H. (2020). Does SARS-CoV-2 has a longer incubation period than SARS and MERS? J Med Virol, 92(5), 476-478. https://doi.org/10.1002/jmv.25708

Lai, A., Bergna, A., Acciarri, C., Galli, M., & Zehender, G. (2020). Early phylogenetic estimate of the effective reproduction number of SARS-CoV-2. J Med Virol, 92(1): 675-679. https://doi.org/10.1002/jmv.25723

Lai, C. C., Shih, T. P., Ko, W. C., Tang, H. J., & Hsueh, P. R. (2020). Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and coronavirus disease-2019 (COVID-19): The epidemic and the challenges. Int J Antimicrob Agents, 55(3): 105924-105933. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2020.105924

Leng, L., Ma, J., Zhang, L., Li, W., Zhao, L., Zhu, Y., Wu, Z., Cao, R., & Zhong, W. (2020). Potential microenvironment of SARS-CoV-2 infection in airway epithelial cells revealed by Human Protein Atlas database analysis. bioRxiv, 1(1): 1-16. https://doi.org/10.1101/2020.04.16.045799

Li, J., Guo, M., Tian, X., Liu, C., Wang, X., Yang, X., Wu, P., Xiao, Z., Qu, Y., Yin, Y., Fu, J., Zhu, Z., Liu, Z., Peng, C., Zhu, T., & Liang, Q. (2020). Virus-host interactome and proteomic survey of PMBCs from COVID-19 patients reveal potential virulence factors influencing SARS-CoV-2 pathogenesis. bioRxiv, 1(1): 1-19. https://doi.org/10.1101/2020.03.31.019216

Lokman, S. M., Rasheduzzaman, M., Salauddin, A., Barua, R., Tanzina, A. Y., Rumi, M. H., Hossain, M. I., Siddiki, A. Z., Mannan, A., & Hasan, M. M. (2020). Exploring the genomic and proteomic variations of SARS-CoV-2 spike glycoprotein: a computational biology approach. bioRxiv, 1(1): 1-26. https://doi.org/10.1101/2020.04.07.030924

Rice GI, D. T., PJ Grant, AJ Turner and NM Hooper. (2004). Evaluation of angiotensin- converting enzyme (ACE), its homologue ACE2 and neprilysin in angiotensin peptide metabolism. Biochem. J., 83: 45-51.

Tang X, W. C., Li X, Song Y, Yao X, Wu X, Duan Y, Zhang H, YWang Y, Qian Z, Cui J, and Lu J. (2020). On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2. National Science Review, 7(6): 1-11. https://doi.org/10.1093/nsr/nwaa036/5775463

Wang, H., Hou, X., Wu, X., Liang, T., Zhang, X., Wang, D., Teng, F., Dai, J., Duan, H., Guo, S., Li, Y., & Yu, X. (2020). SARS-CoV-2 proteome microarray for interactions at amino acid resolution. bioRxiv, 1(1): 1-19. https://doi.org/10.1101/2020.03.26.994756

Wang, Y., Kang, H., Liu, X., & Tong, Z. (2020). Combination of RT-qPCR testing and clinical features for diagnosis of COVID-19 facilitates management of SARS-CoV-2 outbreak. J Med Virol, 92(1): 538-539. https://doi.org/10.1002/jmv.25721

Wu, D., Wu, T., Liu, Q., & Yang, Z. (2020). The SARS-CoV-2 outbreak: What we know. Int J Infect Dis, 94(1): 44-48. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2020.03.004

Yao, X., Ye, F., Zhang, M., Cui, C., Huang, B., Niu, P., Liu, X., Zhao, L., Dong, E., Song, C., Zhan, S., Lu, R., Li, H., Tan, W., & Liu, D. (2020). In Vitro Antiviral Activity and Projection of Optimized Dosing Design of Hydroxychloroquine for the Treatment of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Clin Infect Dis, 71(15): 732-739. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa237

Zhang, H., Penninger, J. M., Li, Y., Zhong, N., & Slutsky, A. S. (2020). Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) as a SARS-CoV-2 receptor: molecular mechanisms and potential therapeutic target. Intensive Care Med, 46(4): 586-590. https://doi.org/10.1007/s00134-020-05985-9

Zhang X, D. X., Wang D, Lu M, Hou X, Wang H, Liang T, Dai J, Duan H, Xu Y, Li Y, Yu X. (2020). Proteome-wide analysis of differentially-expressed SARS-CoV-2 antibodies in early COVID-19 infection. MedRxiv, 1(1): 1-20. https://doi.org/10.1101/2020.04.14.20064535.this

Zhao, J., Yuan, Q., Wang, H., Liu, W., Liao, X., Su, Y., Wang, X., Yuan, J., Li, T., Li, J., Qian, S., Hong, C., Wang, F., Liu, Y., Wang, Z., He, Q., Li, Z., He, B., Zhang, T., Zhang, Z. (2020). Antibody responses to SARS-CoV-2 in patients of novel coronavirus disease 2019. Clin Infect Dis, 1(1): 1-22. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa344

PDF

Publicado

06/11/2025

Número

Sección

Artículos de Investigación

Cómo citar

Santoyo Suárez , M., Constante, J., Arce Hernandez, A., Del Angel Martínez, M., Esquivel Muñoz , G., Morlett Chávez , J., Barrera Ramirez, C., & Martínez Gallegos , J. (2025). Desde el genoma a las proteínas del virus del Síndrome Respiratorio Agudo Severo-Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), una revisión. Cienciacierta, 20(79), 62-78. https://revistas.uadec.mx/CienciaCierta/article/view/245