Búsqueda bioinformática de potenciales blancos genéticos asociados al microRNA -934 en cáncer de mama triple negativo
Palabras clave:
Análisis bioinformático, Cáncer de Mama Triple Negativo, microRNAsResumen
El cáncer de mama se origina cuando las células del tejido mamario comienzan a crecer en forma descontrolada promovida por la transformación de células incapaces de controlar su crecimiento. El cáncer de mama triple negativo se define como un “estado inmunohistoquímico con biología y conducta clínica heterogénea”, con ausencia de expresión de receptores de estrógeno, progesterona y crecimiento epidérmico humano (HER/B2). El objetivo es identificar de manera bioinformática potenciales blancos de genes asociados al mi terapéuticos de microRNAs en cáncer de mama triple negativo.
En la metodología se utilizaron las siguientes bases de datos: microRNA-Segse donde se descargaron muestras de cáncer de mama triple negativo públicamente disponibles en GEO, el control de calidad se realizó mediante la base de datos FASTQCv 0.11.9, para la cuantificación rápida de mapeo se consultó la base de datos miRBase y finalmente la identificación de microRNAs se realizó con ViennaRNA 1.8.4 usando como filtro para la expresión diferencial de p < 0.05 para la obtención de datos me mayor relevancia. Se obtuvieron un total de 29 muestras de microRNA-Seq posteriormente llevó a cabo la expresión diferencial entre pares de condiciones, encontrándose 60 microRNAs de interés, los cuales fueron elegidos mediante los criterios de variación entre grupos y FDR < 0.05 donde se identificaron 20 microRNAs asociados a cáncer de mama triple negativo y se enfocó el análisis en el top 5 de los microRNAs. Se identificaron 20 microRNAs asociados a TNBC de los cuales 5 (hsa-miR-122-5p, hsa-miR-130b-3p, hsa-miR-205-5p, hsa-miR-205-3p y hsa-miR-934.) Se identifico, de manera bioinformática, la predicción del mir 934 con 25 genes asociados a cáncer de mama triple negativo.
En un futuro cercano el tratamiento de las mujeres con cáncer de seno triple negativo podrá ser acompañado por terapias innovadoras como las de los microRNAs, con la finalidad de que las mujeres con cáncer puedan tener una atención personalizada, mejorando así su calidad de vida.
